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Phycobiliprotéines, qu’est-ce-que c’est ?
Ce sont des protéines polymériques naturelles, isolées de certaines microalgues
ou de macro-algues. Elles constituent les pigments accessoires de la
photosynthèse en complément de la chlorophylle. Elles sont constituées par
une partie protéinique de haute masse moléculaire portant des chromophores
responsable de leur couleur.
Les principales phycobiliprotéines sont l’allophycocyanine (APC), la phycocyanine
(PC), les phycoérythrines (R-PE et B-PE) et la phycoérythrocyanine (PEC).
L’APC est isolée de la cyanobactérie Spirulina platensis, la R-PE de ralgue rouge
Porphyra tenera et la B-PE de la micro-algue rouge Porphyridium cruentum.
L’Allophycocyanine Crosslinked (APC-XL) est une APC stabilisée chimiquement
par réticulation. Sous cette forme elle peut supporter l’exposition à des agents
chaotropiques comme le thiocyanate d’ammonium ou la guanidine HCI, tout en
conservant ses propriétés spectrales.
Propriétés
- Coefficient d’absorption spécifique et rendement quantique de fluorescence
élevés.
- Décalage de Stokes important.
- 100% hydrosolubles.
- Stables dans les gammes de pH physiologiques ( 5 à 8 ).
- Couplage à des anticorps ou d’autres protéines par les techniques
conventionnelles sans altération de leurs propriétés spectrales.
- Excitation par les lasers courants hélium-néon, krypton ou argon.
Applications
APC, APC-XL et RPE constituent ainsi des marqueurs très adaptés aux applications suivantes :
- Cytométrie de flux et tri cellulaire (FACS)
- Microscopie de fluorescence confocale
- Marquage de gel d’électrophorèse
- Marquage en chromatographie sur gel d’exclusion
- Marquage enzymatique
- Immunohistochimie
- Immunodétection
- Dosage multi-analytes simultanés
- DNA microarrays
- Screening à haut débit
- Dosage d’analytes par transfert d’énergie de fluorescence (FRET)
- Dosage d’analytes par fluorescence en temps résolu en condition homogène (HTRF)
Précisions concernant les fiches techniques
Le ratio d’absorbance entre l’absorbance maximum et l’absorbance à 280 nm est un indicateur de la
pureté de la phycobiliprotéine par rapport aux contaminants protéiques n’absorbant qu’à 280 nm.
Pour l’APC, le rapport A650/A620 est un indicateur de la contamination par la C-Phycocyanine dont
le maximum d’absorption se situe à 620 nm. Ce rapport est aussi un indicateur de l’état d’intégrité
de l’APCl, puisque la dissociation de l’APC trimérique génère des monomères dont le maximum
d’absorption se situe aussi à 620 nm.
Pour la R-PE, le rapport A565/ A498 est un indicateur de l’identité du pigment purifié; la R-PE absorbe fortement à 498nmnm alors que la B-PE ne présente qu’un léger épaulement à cette longueur d’onde. Le ratio A565/ A498 <1,5 n’est mesurable que lorsqu’un important pic secondaire est présent, ceci indiquant qu’il s’agit bien de R-PE non contaminée par de la B-PE.
Conservation : |
2 à 4°C à l’abri de la lumière. Ne pas congeler |
Péremption : |
1 an |
| Allophycocyanine (APC)
6-APC à partir de 10 mg |
Allophycocyanine réticulé (APCXL)
6-APCXL à partir de 10 mg |
R-Phycoérythrine (R-PE)
6-R-PE à partir de 10 mg |
|
Source : Notre APC est isolé de la cyanobactérie Spirulina sp. Poids moléculaire (PM) : 104 000 +/- 4000 daltons (D) (Bryant, 1976) Origine : l’APC a été isolée de cyanobactéries (Spirulina, Lyngbia,
Caractéristiques structurales : L’APC est une protéine trimérique où les monomères sont
composés de deux sous - unités différentes α et ß caractérisées
par électrophorèse SDS-PAGE. L’organisation de la structure des
sous- unités est notée (αß)3.
Caractéristiques spectrales : Notre APC présente un pic d’absorption maximum à 652 nm +/- 3nm
avec un épaulement à 620 nm.
Pureté : Ratio A652/A620 > 1.55 |
Source : Notre APCXL est préparée à partir d’APC isolée de la cyanobactérie Spirulina sp. Poids moléculaire (PM) : 104 000 +/- 4000 daltons (D)
Caractéristiques structurales : L’APC est une protéine trimérique où les monomères sont
composés de deux sous - unités différentes α et ß caractérisées
par électrophorèse SDSPAGE. L’organisation de la structure des
sous - unités est noté (αß)3.
Caractéristiques spectrales : Notre APCXL présente un pi-c d’absorption maximum à 650 nm +/-
3nm avec un épaulement à 620 nm.
Pureté : Ratio A650/A620 > 1.45 |
Source : Notre R-PE est isolée de l’algue rouge Porphyra tenera. Poids moléculaire (PM) : Notre R-PE a un PM de 240 000 daltons (D).La littérature fait état de PM allant de 214 000 à 290 000 daltons. Origine : De la R-PE a été isolée de cyanobactéries (Bryant, 1982) et
Caractéristiques structurales : La R-PE est une protéine polymérique composée de trois sous - unités.
L’organisation de la structure des sous- unités est notée (αß)6γ.
Caractéristiques spectrales : Les fortes absorptions des bandes de la R-PE se situent dans la région
visible du spectre allant des longueurs d’onde du vert au rouge. La
variabilité de l’absorbance spectrale des espèces de R-PEs reflète les
différences obtenues dans le ratio PEB : PUB des sous unités.
Pureté : Ratio A565/A280 > 5.0 |
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